小产权房不能办房产证。

如果城镇居民在农村购置小产权房的，属于违法用地，房屋登记机关不能为其进行登记和发证。其签署的房屋买卖协议也是无效的的，买方可以要求卖方给予相应的赔偿。

《关于农村集体土地确权登记发证的若干意见》规定，对于借户籍制度改革或者擅自通过‘村改居’等方式非经法定征收程序将农民集体土地转为国有土地、农村集体经济组织非法出让或出租集体土地用于非农业建设、城镇居民在农村购置宅基地、农民住宅或‘小产权房’等违法用地，不得登记发证。

《关于农村集体土地确权登记发证的若干意见》

对于借户籍制度改革或者擅自通过‘村改居’等方式非经法定征收程序将农民集体土地转为国有土地、农村集体经济组织非法出让或出租集体土地用于非农业建设、城镇居民在农村购置宅基地、农民住宅或‘小产权房’等违法用地，不得登记发证。